Η πλειοψηφία των 223 ειδών πουλιών που έχουν καταγραφεί στα Αντικύθηρα περνούν από το νησί κατά τις μεταναστευτικές περιόδους. Τα είδη που αναπαράγονται σε τακτική βάση είναι η Νησιώτικη Πέρδικα (Alectoris chukar), ο Θαλασσοκόρακας (Phalacrocorax aristotelis), ο Γαλαζοκότσυφας (Monticola solitarius), ο Μαυροτσιροβάκος (Sylvia melanocephala), το Κοράκι (Corvus corax), ο Χωραφοσπουργίτης (Passer hispaniolensis), το Βραχοκιρκίνεζο (Falco tinnunculus), ο Πετρίτης (Falco peregrinus), ο Mαυροπετρίτης (Falco eleonorae), η Γερακίνα (Buteo buteo) και η Τυτώ (Tyto alba).

Εκτός από τα γνωστά είδη που έχουν παρατηρηθεί στο νησί, τα τελευταία χρόνια έχουν καταγραφεί και είδη τα οποία είναι σπάνια στον ελληνικό χώρο. Αυτά είναι τα ακόλουθα:

Στεπαετός (Aquila nipalensis)

• Ασιατικό Μαυροκιρκίνεζο (Falco amurensis)
• Στεπογέρακο (Falco cherrug)
• Πρασινομέροπας (Merops persicus)
• Γαλαζολαίμης (Luscinia svecica)
• Καστανοστριτσίδα (Iduna opaca)
• Ορφεοστριτσίδα (Hippolais polyglotta)
• Κεδροφυλλοσκόπος (Phylloscopus nitidus)
• Κιτρινόφρυδος Φυλλοσκόπος (Phylloscopus inornatus)
• Δυτικός Βουνοφυλλοσκόπος (Phylloscopus bonelli)
• Ερημοπύρρουλας (Bucanetes githagineus)
• Ροδόσπιζα (Carpodacus erythrinus)
• Νανοτσίχλονο (Emberiza pusilla)

Φωτογραφίες: